目前我國很多養殖戶并不清楚養殖場場內的正確消毒操作，在消毒劑市場由于生產和銷售存在著一些不規范的情況，消毒劑中魚龍混雜，也給養殖戶的選擇帶來困惑。目前獸醫用消毒劑按其成分可分為堿類消毒劑、酸類消毒劑、酚類消毒劑、醛類消毒劑、醇類消毒劑、鹵素類消毒劑、氧化劑類消毒劑、季銨鹽類消毒劑、揮發性烷化劑和復合型消毒劑等十類。

在傳統使用的消毒劑中，酸類和堿類消毒劑能溶解蛋白質或水解病原微生物的蛋白質和核酸，使其酶系統和細胞結構受到破壞，對病原微生物呈現強大的殺滅力，對病毒、細菌及其芽孢都具有極好的殺滅力。但是由于酸類和堿類能腐蝕有機組織，對人和動物，對木材、金屬也具有腐蝕力，極大地限制了這些消毒劑的使用范圍。

含氯消毒劑，它們對細菌的原生質及其它結構成分有高度親和力，易滲入細胞與菌體的原漿蛋白的氨基或其它基團相結合，使有機物分解或喪失功能而呈現殺菌作用。

酚類消毒劑包括苯酚、煤酚（來蘇爾）和復合酚等，酚類消毒劑可使菌體蛋白質變性、沉淀而呈現殺菌作用。苯酚、來蘇爾等由于殺菌力不強，毒性較大，且對環境造成一定的污染，近年來已經有被國家禁止生產和使用的傾向，該類產品正逐步被淘汰。

其它常用消毒劑主要有醇類的乙醇、氧化劑類的高錳酸鉀，這兩種消毒劑常作為體表局部消毒用，不能用作環境消毒的消毒劑。而雜環類消毒劑環氧乙烷在國內養殖業中使用不多。

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